1999年，一艘神秘的外星宇宙战舰坠落地球，人们花了10年时间将之修复并命名为“MACROSS”。可是，举行起航典礼的当天，月球轨道附近突然出现超太空重叠反应，而MACROSS的主炮竟自动发射，击中杰特拉蒂帝国的侦察舰，第一次宇宙战争由此爆发。MACROSS要塞想利用空间跳跃摆脱敌人，可是由于系统故障跳跃到冥王星轨道。公元2009年，土星轨道上，MACROSS要塞缓缓的向地球行进。要塞内部正在……