集齐六本“伊苏之书”的亚特鲁被强大的力量传送至空中大陆——古伊苏国。被明朗的村中少女莉莉娅救助后，亚特鲁在空中大陆展开了新一轮冒险。 原来，菲娜与蕾雅的身份居然是创立伊苏的双生女神！而古伊苏国，六神官与“黑珍珠”的历史也逐渐浮出水面……