亚历克斯·里德曾经就是一名普通的少年，和在银行做经理的叔叔伊恩·里德相依为命，过着朴实而忙碌的简单日子，直到有一天，伊恩神秘失踪了……两个自称“布朗特先生”和“琼斯夫人”的不速之客拜访了亚历克斯，原来貌似平凡的伊恩竟然拥有着一个不平凡的秘密身份--英国情报组织MI6的间谍，而亚历克斯也在这种身不由己的情况下被拉入伙。“布朗特先生”和“琼斯夫人”是MI6特别计划的负责人，他们要训练亚历克斯接替他叔叔的位置，继续伊恩没有完成的任务。在受训的过程中，亚历克斯才明白，原来叔叔早就在暗中将自己不知不觉训练成了一名间谍：不但会说多种语言，还是潜水、攀岩和跆拳道有高手，他已经具备了一名合格间谍的一切品质，即使年仅14岁，也没有阻碍他顺利通过MI6为期两周的考核期。然后，组织给亚历克斯配备了最先进的通讯设备后，就允许他正式“上岗”执行任务了。
恰逢亿万富翁达瑞斯·塞伊尔以慈善家的嘴脸为英国的每一所学校都捐赠了一台名为“风暴突击者”的智能巨型计算机……突如其来的“慷慨”引起了MI6的怀疑，他们认为这里肯定潜伏着什么不可告人的秘密，于是派遣亚历克斯以计算机竞赛冠军的身份秘密调查此事。亚历克斯成功地渗透进达瑞斯·塞伊尔被保安重重把守的公司内部，遇见了达瑞斯的两个合作伙伴：泼妇娜迪尔·沃尔和因毁容带着面具的格林先生，而他也在有计划地一步一步接近被“风暴突击者”智能计算机所掩盖的真相。
一个偶然的巧遇，亚历克斯发现了那个应该对他叔叔伊恩的失踪负主要责任的狙击手亚森·格雷格罗维奇也是达瑞斯的手下，到此他终于知道这个被组织MI6轻描淡写的任务根本就不似表面那般简单容易，叔叔的无故失踪就是最好的证明。亚历克斯的调查任务很快就有了进展，他在港口发现了一个奇怪的集装箱，那就是“风暴突击者”的秘密之所在。可就在这个节骨眼上，亚历克斯因为身份曝露而被达瑞斯囚禁，无法向MI6及时汇报发现的情报，而且生命还受到了威胁：他被关在一个大水罐中，当水被注满后，就是他的死期……不过就像所有的间谍片一样，亚历克斯在最后一刻成功逃出，并赶到伦敦，在达瑞斯实施阴谋之前成功地阻止了他。