城市需要英雄们来拯救，黑暗降临到纽约，大反派施莱德和他率领的异族使用铁腕压制一切，从警察到政客都被其所控制。未来似乎看不到希望，直到四位兄弟从下水道崛起，他们从自己身上认识到“忍者神龟”的使命。神龟们和无所畏惧的女记者爱普莉尔以及聪明的摄像师菲诺通力合作，摧毁施莱德的恐怖计划，让这座城市重新恢复宁静。